Yekhanurov sinh ra tại ngôi làng Belkachi ở vùng cực bắc Yakut ASSR, hiện là Cộng hòa Sakha thuộc Liên bang Nga. Cha anh, Ivan Mikhailovich Yekhanurov là người dân tộc Buryat, trong khi mẹ anh, Halyna (tên thật là Helena) Ivanivna là người dân tộc Ba Lan. Giữa năm 1955 và 1963, Yuriy Yekhanurov theo học tại một trường học ở làng Buy, Quận Bichursky, Buryatia. [6] Năm 1963, ông chuyển đến Kyiv, Ukraine, nơi ông đã dành phần lớn cuộc đời và sự nghiệp của mình. Ông có bằng Tiến sĩ Kinh tế, đã kết hôn và có một con trai.

Yekhanurov tốt nghiệp Trường Kỹ thuật xây dựng năm 1967 và Đại học Kinh tế Quốc gia Kyiv năm 1973. Công việc đầu tiên của ông vào năm 1974, ông được giao làm quản lý nhà máy bê tông cốt thép tại công ty nhà nước "Kyivmiskbud-4". Yekhanurov nhanh chóng thăng cấp, chuyển sang tập đoàn công nghiệp "Stroydetal" từ năm 1985 đến năm 1988. Trong năm đó, ông được bổ nhiệm làm phó chủ tịch giám đốc xây dựng Kyiv, "GolovKyivMiskBud".